Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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