Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CTNNA3Q9UI47 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms