Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SL798P-201ENST00000468562 301 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR2AT4-201ENST00000305159 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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