Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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