Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.5 ms