Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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