Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms