Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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