Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms