Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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