Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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