Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms