Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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