Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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