Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms