Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms