Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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