Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HTR4Q13639 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HTR4Q13639 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HTR4Q13639 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HTR4Q13639 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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