Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms