Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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TCOF1Q13428 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
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