Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPFP49454 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPFP49454 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPFP49454 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPFP49454 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPFP49454 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPFP49454 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPFP49454 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPFP49454 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPFP49454 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPFP49454 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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