Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 IPO7P2-201ENST00000451446 1750 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPREP23469 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPREP23469 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPREP23469 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms