Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMEM225BP0DP42 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms