Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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