Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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