Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms