Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSMD6Q15008 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms