Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms