Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms