Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms