Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TTPAP49638 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms