Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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