Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LETM2Q2VYF4 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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