Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
USF2Q15853 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
USF2Q15853 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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