Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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