Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms