Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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