Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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