Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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