Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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