Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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