Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms