Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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