Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms