Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCSER1Q9C0I3 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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