Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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