Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms