Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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SMCO1Q147U7 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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