Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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