Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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